環保署為推動環保事業民營化，於環境檢驗所設立環境檢測機構認證制度，自76年開始推動至84年止為輔導建制階段，家數由2家快速成長至60家。84年至今國內環保檢測需求漸趨平穩，為輔導管理並重之階段。檢測機構成長亦趨緩和，至108年12月為止，許可後營運之環境檢測機構達103家110處檢驗室。

另外環保署為有效管制各汽機車製造廠及進口車輛噪音及排放污染物符合法規排放管制標準，於環境檢驗所設立機動車輛排放空氣污染物及噪音檢驗測定機構認證制度，除各車廠執行自行品管測試外，並執行新車型審驗及新車抽驗之法規測試，至108年12月為止，許可營運之測定機構計有18家21處檢驗室。